用一代测序评估样本DNA中碱基损伤、错配和变异的方法

基本信息

申请号 CN202011604056.X 申请日 -
公开(公告)号 CN113005188A 公开(公告)日 2021-06-22
申请公布号 CN113005188A 申请公布日 2021-06-22
分类号 C12Q1/6869;G16B25/20;G16B30/00;G16B50/30 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 罗俊峰;王一帆;徐雪;陈曦;宋萍 申请(专利权)人 阅尔基因技术(苏州)有限公司
代理机构 苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 王玉仙
地址 215000 江苏省苏州市工业园区桑田街218号生物医药产业园二期20号楼301单元
法律状态 -

摘要

摘要 本发明涉及一种用一代测序评估样本DNA中碱基损伤、错配和变异的方法,本发明在PCR扩增过程中一方面采用分子标签来标记带有损伤或者错配的DNA原始分子,另一方面对抽样区域进行富集放大扩增,将0.1%左右的损伤或者错配信息放大到10~99%,然后采用基于富集放大作用的评估方法和基于分子标签种类数量的评估方法分别评估样本DNA中碱基损伤、错配和变异的比例值,根据两种方法的可信结果,判断样本DNA中碱基损伤、错配和变异的比例值。本发明的方法能够采用经济快速的sanger测序方法准确的确认损伤或者错配真实存在,能够有利于优化样本DNA提取技术和保存方法,帮助评估样本DNA的质量。