一种检测CRISPR-Cas9脱靶效应的方法

基本信息

申请号 CN201910115862.1 申请日 -
公开(公告)号 CN109971842A 公开(公告)日 2019-07-05
申请公布号 CN109971842A 申请公布日 2019-07-05
分类号 C12Q1/686(2018.01)I; C12Q1/6869(2018.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 邓涛; 李倩; 王越; 喻堃; 卢铀 申请(专利权)人 成都美杰赛尔生物科技有限公司
代理机构 成都玖和知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 胡琳梅
地址 610041 四川省成都市高新区益州大段中段722号2栋1单元6层612号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种检测CRISPR‑Cas9脱靶效应的方法,属于基因工程技术领域,其步骤包括:a.采用软件预测sgRNA的脱靶位点,并获得PCR扩增引物;b.选取基因样本,所选基因样本包括基因编辑样本和未进行基因编辑样本;c.PCR扩增预测出的脱靶位点;d.对PCR产物进行高通量测序;e.结果分析,序列比对;本发明根据指定的比对规则,将所述基因编辑后的样本与未进行基因编辑的对照样本进行比对,而不仅仅和数据库中的信息进行比对,也不需要获得子代或亲本样本基因信息,实现个性化的找寻细胞基因组上的可能脱靶位点,提高脱靶检测的准确度和灵敏度,从而提高了基因编辑的安全性。