构建细胞全转录本扩增产物的方法及其应用

基本信息

申请号 CN201711475632.3 申请日 -
公开(公告)号 CN109988825A 公开(公告)日 2019-07-09
申请公布号 CN109988825A 申请公布日 2019-07-09
分类号 C12Q1/6851(2018.01)I; G01N33/574(2006.01)I; G01N33/569(2006.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 郭琦; 王秀莉; 董超; 李长平; 卢孟孟; 宋廷瑞 申请(专利权)人 杭州莲和医学检验所有限公司
代理机构 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 杭州莲和医学检验所有限公司
地址 310000 浙江省杭州市滨江区长河街道滨安路688号5幢五层501室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提出了一种构建细胞全转录本扩增产物的方法。该方法包括:将细胞样品进行磁珠捕获处理,以便获得待处理细胞;以及将所述待处理细胞进行单细胞全转录本扩增,以便获得所述待处理细胞的全转录本扩增产物,其中,进行单细胞全转录本扩增之前,进一步包括将所述待处理细胞进行裂解处理,所述裂解处理是通过向所述待处理细胞中加入PBS和裂解液进行的,基于1~100个待处理细胞,所述PBS的用量为7微升,所述裂解液的用量为4微升,所述裂解液包括100mM Tris‑HCl、500mM KCl、25mM MgCl2、10%NP40、0.1M DTT、RNA酶抑制剂(40U/μl)、0.5μM UP1引物、2.5mM dNTP以及无核酸酶水。该方法将磁珠捕获技术与单细胞全转录本扩增技术巧妙相结合,严格控制待处理细胞与裂解液和PBS的加入量,可稳定获得微量细胞(如循环肿瘤细胞)全转录本扩增产物。