一种基于PGM高通量测序技术指导幽门螺杆菌根除用药的方法

基本信息

申请号 CN201610194552.X 申请日 -
公开(公告)号 CN107236787A 公开(公告)日 2017-10-10
申请公布号 CN107236787A 申请公布日 2017-10-10
分类号 C12Q1/68(2006.01)I;C12R1/01(2006.01)N 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 杨比特;许佩松;杨宁敏 申请(专利权)人 杭州致远医学检验所有限公司
代理机构 - 代理人 -
地址 310030 浙江省杭州市西湖区西园二路1号2幢6层-1
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种基于PGM高通量测序技术指导幽门螺杆菌根除用药的方法,其主要是针对于幽门螺杆菌对抗生素的耐药性以及宿主药物代谢酶类型的检测。本方法主要包括:设计覆盖VacA、23SrRNA、gyrA、CYP2C19*2、CYP2C19*3基因待测区域的特异性引物,形成Primer Pool;提取宿主和幽门螺杆菌基因组进行扩增;进行PGM文库制备、纯化、定量、测序;计算出耐药比例和药物代谢酶类型。本发明利用多重PCR技术实现多位点的同时扩增,结合PGM测序,有利于指导临床关于幽门螺杆菌的检测和根除。