一种非诊断目的的检测幽门螺杆菌基因及药物代谢型的Miseq测序方法
基本信息
申请号 | CN201610194555.3 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN107236788B | 公开(公告)日 | 2021-07-02 |
申请公布号 | CN107236788B | 申请公布日 | 2021-07-02 |
分类号 | C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/04 | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 杨比特;许佩松;杨宁敏 | 申请(专利权)人 | 杭州致远医学检验所有限公司 |
代理机构 | - | 代理人 | - |
地址 | 310030 浙江省杭州市西湖区西园二路1号2幢6层-1 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供了一种同时检测幽门螺杆菌基因及药物代谢型的Miseq测序方法,其包括以下几步:设计覆盖UreB、23SrRNA、gyrA、CYP2C19*2、CYP2C19*3基因待测区域的特异性引物,形成Primer Pool;提取宿主和幽门螺杆菌基因组进行扩增:二次扩增进行文库制备、纯化、定量;Miseq高通量测序和分析;计算出耐药比例和药物代谢酶类型。本发明利用多重PCR技术将待测片段在一个反应中实现扩增,结合Miseq测序和分析,即可获得幽门螺杆菌感染情况、耐药情况及宿主药物代谢酶CYP2C19基因多态性类型,有利于指导临床关于幽门螺杆菌的检测和根除。 |
