一种非诊断目的的检测幽门螺杆菌基因及药物代谢型的Miseq测序方法

基本信息

申请号 CN201610194555.3 申请日 -
公开(公告)号 CN107236788B 公开(公告)日 2021-07-02
申请公布号 CN107236788B 申请公布日 2021-07-02
分类号 C12Q1/6869;C12Q1/689;C12Q1/04 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 杨比特;许佩松;杨宁敏 申请(专利权)人 杭州致远医学检验所有限公司
代理机构 - 代理人 -
地址 310030 浙江省杭州市西湖区西园二路1号2幢6层-1
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种同时检测幽门螺杆菌基因及药物代谢型的Miseq测序方法,其包括以下几步:设计覆盖UreB、23SrRNA、gyrA、CYP2C19*2、CYP2C19*3基因待测区域的特异性引物,形成Primer Pool;提取宿主和幽门螺杆菌基因组进行扩增:二次扩增进行文库制备、纯化、定量;Miseq高通量测序和分析;计算出耐药比例和药物代谢酶类型。本发明利用多重PCR技术将待测片段在一个反应中实现扩增,结合Miseq测序和分析,即可获得幽门螺杆菌感染情况、耐药情况及宿主药物代谢酶CYP2C19基因多态性类型,有利于指导临床关于幽门螺杆菌的检测和根除。