一种肺癌围手术期分子残留病灶基因检测panel及检测模型的构建方法

基本信息

申请号 CN202111519375.5 申请日 -
公开(公告)号 CN114187964A 公开(公告)日 2022-03-15
申请公布号 CN114187964A 申请公布日 2022-03-15
分类号 G16B20/50(2019.01)I;G16B20/30(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I;C40B50/06(2006.01)I;C12Q1/6886(2018.01)I;C12Q1/6806(2018.01)I 分类 物理
发明人 许明炎;何长寿;周衍庆;陈亚如;陈实富;杨庆;刘园园;张晓妮 申请(专利权)人 深圳市海普洛斯生物科技有限公司
代理机构 北京方圆嘉禾知识产权代理有限公司 代理人 戴嵩玮
地址 518000广东省深圳市前海深港合作区前湾一路1号A栋201室(入驻深圳市前海商务秘书有限公司)
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种肺癌围手术期分子残留病灶基因检测panel及检测模型的构建方法,涉及生物信息学技术领域。本发明通过整合肿瘤数据库和TCGA、COSMIC等著名肿瘤公共数据库,设计了一款覆盖肺癌驱动基因、靶向用药基因及热点突变的肺癌MRD基因检测panel,并开发了一套检测超低频基因突变预测模型。本发明以大样本量数据作为基础,聚焦肺癌驱动基因和热点突变,保证检测结果准确性;超高测序深度,保证了超低频检测限,超低频基因突变算法,提高突变检测精准度。本发明实施例证实,所述预测模型可以稳定检测0.02%的超低频突变。