基于一代测序技术的自动化菌种鉴定方法、系统、终端及介质

基本信息

申请号 CN202110645390.8 申请日 -
公开(公告)号 CN113345522A 公开(公告)日 2021-09-03
申请公布号 CN113345522A 申请公布日 2021-09-03
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B30/20(2019.01)I;G16B40/10(2019.01)I;G16B50/30(2019.01)I 分类 物理
发明人 胡万金;黄龙;马贝贝 申请(专利权)人 上海美吉生物医药科技有限公司
代理机构 上海光华专利事务所(普通合伙) 代理人 倪静
地址 201321上海市浦东新区中国(上海)自由贸易试验区高科中路2810弄8号1204室单元D
法律状态 -

摘要

摘要 本发明的基于一代测序技术的自动化菌种鉴定方法、系统、终端及介质,通过依次搭建的文件格式检查、序列长度质控、峰图文件的杂峰判定、序列拼接和数据库比对流程进行自动化菌种鉴定,本方案提供了完整的过滤质控方法来判定一代测序数据的质量,减少了工作运行的时间,提高了处理项目的效率,并且提高了鉴定的准确性;并整合了对一代测序各数据处理方式的优势,做到了批量化处理一代测序数据,并提供了后续更为重要的菌种鉴定功能,使得一代测序菌种鉴定的功能更加完善;更首次做到一代测序菌种鉴定流程自动化,极大的提高了工作效率。