基于DNA标记的犬类品系鉴定方法
基本信息
申请号 | CN201711109335.7 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN107871060A | 公开(公告)日 | 2018-04-03 |
申请公布号 | CN107871060A | 申请公布日 | 2018-04-03 |
分类号 | G06F19/22;G06F19/24;G06F19/28;G06K9/62 | 分类 | 计算;推算;计数; |
发明人 | 刘毓文;杨承;耿灿 | 申请(专利权)人 | 深圳深知生物科技有限公司 |
代理机构 | 深圳卓正专利代理事务所(普通合伙) | 代理人 | 深圳深知生物科技有限公司 |
地址 | 518100 广东省深圳市龙岗区龙岗街道清风大道39号C栋5楼 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开了一种通过宠物犬DNA SNP标记准确进行品系鉴定的方法,所述方法包括步骤:1)获得宠物犬DNA SNP标记数据;2)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行层次聚类,所述层次聚类中加入了迁徙的参数;3)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行种群混合物分析,所述种群混合物分析中,对混合品系的数量加以限制;4)将基因组分成小块区域,并对每一个区域用随机森林算法进行犬种归类,用隐马尔可夫链对小块基因区域的品系归类进行平滑处理,用最大释然估计对家族谱系进行估计,获得犬只父母的品系混合成分,完成谱系推断。 |
