基于DNA标记的犬类品系鉴定方法

基本信息

申请号 CN201711109335.7 申请日 -
公开(公告)号 CN107871060B 公开(公告)日 2018-04-03
申请公布号 CN107871060B 申请公布日 2018-04-03
分类号 G16B30/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 刘毓文;杨承;耿灿 申请(专利权)人 深圳深知生物科技有限公司
代理机构 深圳卓正专利代理事务所(普通合伙) 代理人 深圳深知生物科技有限公司
地址 518100广东省深圳市龙岗区龙岗街道清风大道39号C栋5楼
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种通过宠物犬DNA SNP标记准确进行品系鉴定的方法,所述方法包括步骤:1)获得宠物犬DNA SNP标记数据;2)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行层次聚类,所述层次聚类中加入了迁徙的参数;3)对步骤1)中所述的SNP标记数据进行种群混合物分析,所述种群混合物分析中,对混合品系的数量加以限制;4)将基因组分成小块区域,并对每一个区域用随机森林算法进行犬种归类,用隐马尔可夫链对小块基因区域的品系归类进行平滑处理,用最大似然估计对家族谱系进行估计,获得犬只父母的品系混合成分,完成谱系推断。