病原微生物分析鉴定系统及应用
基本信息
申请号 | CN202010281509.3 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN111462821A | 公开(公告)日 | 2020-07-28 |
申请公布号 | CN111462821A | 申请公布日 | 2020-07-28 |
分类号 | G16B30/00(2019.01)I | 分类 | - |
发明人 | 许腾;陈文景;张丽珍;刘足;潘秀莹;曾伟奇;秦璐;李永军;王小锐;苏杭 | 申请(专利权)人 | 微远(深圳)医学研究中心有限公司 |
代理机构 | 广州新诺专利商标事务所有限公司 | 代理人 | 广州微远基因科技有限公司;广州微远医疗器械有限公司;广州微远医学检验实验室有限公司;深圳微远医疗科技有限公司 |
地址 | 510130广东省广州市高新技术产业开发区科丰路31号自编三栋华南新材料创新园G10栋303号 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明涉及一种病原微生物分析鉴定系统及应用,属于基因检测分析技术领域。该病原微生物分析鉴定系统包括:数据获取模块:用于获取高通量测序得到的基因测序数据;数据过滤模块:用于将依次进行低质量序列过滤、宿主序列过滤;数据比对模块:用于将序列比对至病原微生物基因组数据库中;物种比对模块:用于统计待分析序列;数据分析模块:用于计算共有比对序列集中各序列对比上每一个物种的相似度S和平均相似度值SMSi;物种序列模块:用于计算物种的总比对序列数SNTi;结果输出模块:用于进行生物信息学分析,得到病原微生物分析鉴定结果。该病原微生物分析鉴定系统不仅具有分析时间短、准确性高的优点;还可准确得检测混合感染,获得具体病原体信息。 |
