判断背景引入微生物序列的方法及其应用
基本信息
| 申请号 | CN202110466665.1 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113270145B | 公开（公告）日 | 2022-05-06 |
| 申请公布号 | CN113270145B | 申请公布日 | 2022-05-06 |
| 分类号 | G16B30/10（2019.01）I;G16B40/20（2019.01）I;G16B40/30（2019.01）I;G16B50/00（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 许腾;何福生;李晓蕾;谢淑媚;王小锐;李永军;苏杭 | 申请（专利权）人 | 微远（深圳）医学研究中心有限公司 |
| 代理机构 | 广州新诺专利商标事务所有限公司 | 代理人 | 李海恬 |
| 地址 | 510130广东省广州市高新技术产业开发区科丰路31号自编三栋华南新材料创新园G10栋303号 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及一种判断背景引入微生物序列的方法及其应用，属于生物信息分析技术领域。该方法包括以下步骤：确定背景微生物列表：取若干病原微生物阴性样本，将各微生物丰度的定量值A与核酸总量D进行相关性检验，呈负相关则判定为背景病原微生物；判断模型建立：分别取背景病原微生物的阴性对照样本集和阳性样本集，将背景病原微生物基因序列数据比对至该微生物的特征序列区域，计算丰度，建立判断模型；微生物特异性区域定量分析：获取待测样本中背景病原微生物基因序列数据，采用上述判断模型进行判断。该方法能够准确判断测序所得微生物序列是否为背景引入，且可降低批次假阳或者假阴问题，可广泛应用于病原微生物检测的数据分析中。 |
