一种基于大数据的染色体异常位点的筛选方法

基本信息

申请号 CN201710492071.1 申请日 -
公开(公告)号 CN107194206A 公开(公告)日 2017-09-22
申请公布号 CN107194206A 申请公布日 2017-09-22
分类号 G06F19/22(2011.01)I;G06F19/28(2011.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 沈雨后 申请(专利权)人 精医光瀚科技(上海)有限公司
代理机构 - 代理人 -
地址 201800上海市崇明县长兴镇潘园公路1800号3号楼8376室(上海泰和经济发展区)
法律状态 -

摘要

摘要 本案为一种基于大数据的染色体异常位点的筛选方法,包括:建立数据库:在PubMed数据库中检索文献,根据所检索文献的摘要筛选出符合预设条件的相关联文献,将相关联文献下载到计算机的存储器,建立一个数据库;确定位点的比值比;核查位点的频率:在HapMap数据库中输入所述位点,确定出在预设人群范围内所述HapMap数据库中所述位点对应基因型的研究频率,剔除没有频率以及最小等位基因频率小于3%的位点;预实验验证:选取细胞样本并进行DNA抽提,采用RT‑PCR技术进行DNA分型并进行数据分析,若数据分析显示出预设分型结果,则将预设异常位点确定为异常位点。本案利用大数据能够快速、精准地筛选出染色体异常位点。