基于系统进化树的泛基因组构建方法和构建装置
基本信息
| 申请号 | CN202010260748.0 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN111477281A | 公开（公告）日 | 2020-07-31 |
| 申请公布号 | CN111477281A | 申请公布日 | 2020-07-31 |
| 分类号 | G16B40/30(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I | 分类 | - |
| 发明人 | 张锦波;鲍冠辉;李季 | 申请（专利权）人 | 天津诺禾医学检验所有限公司 |
| 代理机构 | 北京康信知识产权代理有限责任公司 | 代理人 | 北京诺禾致源科技股份有限公司;北京诺禾致源生物科技有限公司;天津诺禾致源生物信息科技有限公司;天津诺禾医学检验所有限公司;南京诺禾致源生物科技有限公司 |
| 地址 | 102200北京市昌平区回龙观镇生命园路29号创新大厦B258室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供了一种基于系统进化树的泛基因组构建方法和构建装置。该构建方法包括：对不同株系的菌株进行系统进化树构建，得到系统进化树；根据不同株系的菌株在系统进化树上的不同位置，按照从底层到顶层的方向两两聚类，逐层进行泛基因组构建，得到不同株系总的泛基因组。该方法从底层到顶层的泛基因组构建，不仅解决了现有方法中比对结果不准确的问题，而且使得每一个进化节点的泛基因组都可以得到，从而可以从更加细致的进化角度来分析存在/缺失变异结果。 |
