染色体拷贝数变异程度评估模型、方法及应用

基本信息

申请号 CN202210408054.6 申请日 -
公开(公告)号 CN114724631A 公开(公告)日 2022-07-08
申请公布号 CN114724631A 申请公布日 2022-07-08
分类号 G16B30/00(2019.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I;C12Q1/6886(2018.01)I 分类 物理
发明人 王一凡;金鸽;曹建军;徐小红;陈阅军 申请(专利权)人 上海仁东医学检验所有限公司
代理机构 上海市汇业律师事务所 代理人 -
地址 200120上海市浦东新区半夏路100弄11号1-3层、地下1层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种染色体拷贝数变异程度评估模型,该模型根据拷贝数变异负荷评估染色体拷贝数变异程度,所述拷贝数变异负荷为发生拷贝数变异的bin的数目与全基因组bin的数目的比值。本发明还公开了上述模型的构建方法,以及基于该模型的染色体拷贝数变异程度评估方法及其应用。本发明通过构建背景库和染色体拷贝数变异负荷模型,对膀胱癌肿瘤患者尿液上清cfDNA中的染色体不稳定性进行评估,建立了全基因组bin拷贝数水平和患者样本水平的染色体不稳定性评价方法,该方法具有较高的准确性、敏感性和特异性。