基于微生物丰度的MIBC分型及预后预测模型构建方法
基本信息
| 申请号 | CN202210148697.1 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN114203256B | 公开（公告）日 | 2022-06-21 |
| 申请公布号 | CN114203256B | 申请公布日 | 2022-06-21 |
| 分类号 | G16B15/30;G16B20/00;G16B30/00;G16B40/00 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 金鸽;薛银鸽;林为丽;徐小红;赵婷婷 | 申请（专利权）人 | 上海仁东医学检验所有限公司 |
| 代理机构 | 上海市汇业律师事务所 | 代理人 | 陆红杰 |
| 地址 | 201318 上海市浦东新区半夏路100弄11号1-3层、地下1层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种肌层浸润性膀胱癌（MIBC）分型方法，该方法依据MIBC患者的组织微生物丰度谱特征对MIBC进行分子分型。本发明还公开了基于上述分型方法的MIBC预后预测模型及其构建方法。本发明利用TCGA数据库中的肌层浸润性膀胱癌转录组RNA‑seq数据，分析得到MIBC患者的微生物数据，然后以微生物丰度谱为特征进行NMF聚类，建立MIBC微生物层面的分子分型，从而从肿瘤组织微生物层面深度解析了微生物与MIBC的相关性，建立了MIBC预后预测模型，该模型有助于精准预测MIBC患者的1‑5年生存率。 |
