微卫星不稳定的预测方法及其应用

基本信息

申请号 CN202010098341.2 申请日 -
公开(公告)号 CN111304303A 公开(公告)日 2020-06-19
申请公布号 CN111304303A 申请公布日 2020-06-19
分类号 C12Q1/6858;G16B20/20;G16B20/30;G16B40/00 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 吴书昌;白健;王寅 申请(专利权)人 福建和瑞精创基因技术有限公司
代理机构 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 代理人 潘浩
地址 350000 福建省福州市长乐市数字福建产业园东湖路33号7号研发楼
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种微卫星不稳定的检测预测方法,以及相关的位点筛选方法、模型构建方法及应用。所述位点筛选方法:i)包含测定样本中候选微卫星位点的微卫星不稳定预测值的步骤;和/或ii)使用包括候选微卫星位点的微卫星不稳定预测值在内的一种或多种指标筛选用于微卫星不稳定检测的位点或位点组合;所述微卫星不稳定预测值是候选微卫星位点中主等位基因(allele)型与次等位基因型之间丰度差异的量化值。本发明的方法准确性高,仅基于单肿瘤样本就可以精准稳定地检测MSI状态。