检测HLA杂合性缺失的方法及系统
基本信息
| 申请号 | CN202010302140.X | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN112885406A | 公开（公告）日 | 2021-06-01 |
| 申请公布号 | CN112885406A | 申请公布日 | 2021-06-01 |
| 分类号 | G16B20/20;G16B20/30;G16B30/10 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 朱嘉麒;聂新华;李艳 | 申请（专利权）人 | 深圳裕策生物科技有限公司 |
| 代理机构 | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 | 代理人 | 周建军;郭燕 |
| 地址 | 518081 广东省深圳市盐田区海山街道深盐路2002号大百汇高新技术工业园A栋913 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提供一种检测HLA杂合性缺失的方法及系统，该方法包括：数据获取：获取肿瘤样本和对照样本的测序数据；HLA分型检测：检测肿瘤样本、对照样本的HLA分子类型；HLA等位基因不平衡检测：将测序数据与HLA分型结果比对，获得HLA等位基因不平衡检测结果；拷贝数变异检测：对所有目标区域进行拷贝数变异检测，获得HLA基因座的拷贝数变异检测结果；HLA杂合性缺失判断：根据HLA等位基因不平衡检测结果、拷贝数变异检测结果，判断是否为HLA杂合性缺失。本发明不只单独使用HLA基因上的序列信息，还结合HLA基因附近的序列信息，得到准确的HLA LOH结果。 |
