一种检测肿瘤异质性程度的方法及系统
基本信息
申请号 | CN202010231560.3 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN111402952A | 公开(公告)日 | 2020-07-10 |
申请公布号 | CN111402952A | 申请公布日 | 2020-07-10 |
分类号 | G16B20/30(2019.01)I | 分类 | - |
发明人 | 金皓玄;方文峰;陈龙昀;苏小凡;廖裕威 | 申请(专利权)人 | 深圳裕策生物科技有限公司 |
代理机构 | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 | 代理人 | 深圳裕策生物科技有限公司 |
地址 | 518081广东省深圳市盐田区海山街道深盐路2002号大百汇高新技术工业园A栋913 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供一种检测肿瘤异质性程度的方法及系统,该方法包括:获取肿瘤组织样本和对照样本的测序数据,进行体细胞变异检测,获得体细胞变异位点;将体细胞变异位点按簇进行聚类;根据聚类结果,判断主克隆突变簇和亚克隆突变簇;计算肿瘤组织样本中亚克隆突变簇中的体细胞变异数量占所有体细胞变异数量的比值,该比值即为肿瘤异质性数值。本发明充分利用样本各突变位点检测的突变频率,估算出对应肿瘤克隆的细胞占比,从而推算出肿瘤异质性程度的具体数值,为后续预测免疫治疗疗效提供了一个数值上可以参考的依据。 |
