一种基于纳米孔测序的病毒实时自动分析方法及系统专利查询专利号|摘要-满商公司网

一种基于纳米孔测序的病毒实时自动分析方法及系统

基本信息

申请号	CN202110326137.6	申请日	-
公开（公告）号	CN113096736A	公开（公告）日	2021-07-09
申请公布号	CN113096736A	申请公布日	2021-07-09
分类号	G16B30/10（2019.01）I;G16B20/20（2019.01）I;G16B20/30（2019.01）I	分类	物理
发明人	杜鹏程;余乐;杨童茜	申请（专利权）人	北京源生康泰基因科技有限公司
代理机构	北京工信联合知识产权代理有限公司	代理人	白晓晰
地址	100084北京市海淀区上地信息路26号1层0106-51室
法律状态	-

摘要

本发明公开了一种基于纳米孔测序的病毒实时自动分析方法及系统，包括：按照预设的时间间隔扫描测序数据存储文件夹中的文件，以确定新的测序数据文件；对每个新的测序数据文件进行完整性校验和格式处理，以确定待测文件；对所述待测文件中的每个测序读段数据进行数据清洗，以获取质量合格的第一测序读段数据；将每个第一测序读段数据与预设的病毒基因组参考序列进行比对，并根据第一比对结果筛选，以确定第二测序读段数据；将第二测序读段数据和已存储的测序读段数据进行合并，并和预设的病毒基因组参考序列进行比对，以获得第二比对结果；根据第二比对结果确定测序深度，根据测序深度确定参考基因组覆盖度，并根据参考基因组覆盖度确定分析结果。