通过测序获取微生物物种及相关信息的方法、装置、计算机可读存储介质和电子设备
基本信息
| 申请号 | CN202010790095.7 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN114067911A | 公开（公告）日 | 2022-02-18 |
| 申请公布号 | CN114067911A | 申请公布日 | 2022-02-18 |
| 分类号 | G16B30/10（2019.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 江山;杨玉梅;庞白冰;克里斯托弗·雷·约翰逊 | 申请（专利权）人 | 西安中科茵康莱医学检验有限公司 |
| 代理机构 | 广州华进联合专利商标代理有限公司 | 代理人 | 林青中 |
| 地址 | 710000陕西省西安市高新区新型工业园西部大道60号圆弧楼二楼 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及微生物鉴定领域，具体而言，涉及一种通过测序获取微生物物种及相关信息的方法。该方法包括：i）获取测序数据，所述测序数据由引物对微生物特征序列进行扩增后经下一代测序技术对扩增产物进行测序得到；ii）将所述测序数据与特征序列数据库进行比对分析以鉴定所述待检测样本中的微生物组成；其中所述特征序列数据库预先根据含有所述特征序列的参考序列的相似性做聚类处理，得到一层或多层级的cluster，每个层级cluster中有至少一个子seed，最底层的cluster中有若干作为参考序列的seed。 |
