基于MALDI-TOF质谱数据鉴定细菌混合样品的算法

基本信息

申请号 CN201710517246.X 申请日 -
公开(公告)号 CN107271533B 公开(公告)日 2019-09-13
申请公布号 CN107271533B 申请公布日 2019-09-13
分类号 G01N27/62(2006.01)I 分类 测量;测试;
发明人 余绍宁 申请(专利权)人 浙江和谱生物科技有限公司
代理机构 杭州裕阳联合专利代理有限公司 代理人 浙江和谱生物科技有限公司;传鸣(宁波)化学科技有限公司
地址 310000 浙江省杭州市滨江区长河街道滨安路688号5幢15层1512室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供基于MALDI‑TOF质谱数据鉴定细菌混合样品的算法,包括以下步骤:(1)利用参考数据库中的候选图谱合成模拟混合图谱;(2)评价实验图谱与模拟混合图谱的相似度,选出最可能匹配结果;(3)利用“随机图谱模型法”计算错误检出率。本发明构建的细菌混合样品鉴定算法,实现混合细菌样本的直接鉴定,避免了传统方法步骤繁琐、耗时较长的问题;引入了综合评价样品谱图搜库匹配结果的假设验证方法,以FDR值作为鉴定的阈值,提高了基于谱图相似度计算的搜库匹配结果的可靠性;具有较好的综合评价能力,具有较强的可操作性和实用性。