基于宏基因组的临床重要致病菌毒力基因检测的方法及系统

基本信息

申请号 CN202110579642.1 申请日 -
公开(公告)号 CN113223618A 公开(公告)日 2021-08-06
申请公布号 CN113223618A 申请公布日 2021-08-06
分类号 G16B30/10;G16B40/00;G16B50/10 分类 物理
发明人 夏涵;官远林;江月;樊淑;杨静;胡煜 申请(专利权)人 予果智造科技(北京)有限公司
代理机构 北京冠和权律师事务所 代理人 赵银萍
地址 100000 北京市东城区和平里东街11号37号楼213-B25号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种基于宏基因组的临床重要致病菌毒力基因检测的方法和系统。该方法包括:S10,建立临床致病菌毒力基因数据库;S20,获取临床样本宏基因组测序原始数据,对其预处理获得目标数据;S30,利用预设宏基因组测序数据多重比对注释系统分析目标数据,鉴定毒力基因;S40,建立重要毒力基因‑毒力因子‑表征(功能/临床表型)关联数据库;S50,利用预设临床自动化报告系统,基于毒力基因鉴定结果和关联数据库,生成毒力基因鉴定报告。该系统能够对不同类型(脑脊液等)的临床感染样本的宏基因组测序数据进行毒力基因鉴定,一次性鉴定样本中多种病原菌的多个重要毒力基因,具有较好的灵敏性和准确性,帮助医生及时进行诊断、治疗和预后。