基于高通量测序技术的宿主中病毒来源sRNA数据分析方法

基本信息

申请号 CN202110354949.1 申请日 -
公开(公告)号 CN113066532A 公开(公告)日 2021-07-02
申请公布号 CN113066532A 申请公布日 2021-07-02
分类号 G16B20/30;G16B30/10;G16B45/00 分类 物理
发明人 肖云平;徐天生;杨雨晴;刘钰钏;史贤俊;林博 申请(专利权)人 上海欧易生物医学科技有限公司
代理机构 上海德禾翰通律师事务所 代理人 夏思秋
地址 201114 上海市闵行区浦江镇新骏环路138号5幢302室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提出了一种基于高通量测序技术的宿主中病毒来源sRNA数据分析方法,包括文件准备步骤、下机数据质控步骤、病毒参考基因组比对以及病毒sRNA注释步骤、病毒sRNA定量步骤、差异病毒sRNA分析步骤、宿主靶基因预测步骤、富集分析步骤、网页版报告整理步骤。本发明结果全面,包含涉及到的病毒sRNA分析内容以及其宿主靶基因预测,GO、KEGG富集分析以及对应的可视化展示;自动整理所有分析结果,每一步分析完成之后自动对结果进行汇总统计、可视化以及逻辑化归类整理,结果文件可直接用于生成网页版报告,所有操作步骤可以溯源,方便错误查询,如果分析有报错,会生成对应的报错日志信息。