筛选候选插入片段的方法和系统
基本信息
| 申请号 | CN202010207885.8 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113436683A | 公开（公告）日 | 2021-09-24 |
| 申请公布号 | CN113436683A | 申请公布日 | 2021-09-24 |
| 分类号 | G16B30/00（2019.01）I;G16B40/00（2019.01）I;C12N15/11（2006.01）I;C12N15/13（2006.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 黄慧雅;曹玉冰;刘乙齐;郭亚琨 | 申请（专利权）人 | 北京合生基因科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京清亦华知识产权代理事务所（普通合伙） | 代理人 | 肖阳 |
| 地址 | 102206北京市昌平区中关村生命科学园创新大厦B203室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明提出了一种筛选候选插入片段的方法，所述插入片段用于改造待测样本核酸序列。该方法包括：基于用于改造待测样本核酸序列的候选基因，确定初始基因编码区序列；对所述初始基因编码区序列进行同义密码子替换，以便获得由多个候选编码区序列构成的候选编码区序列集合；将所述候选编码区序列与自身、宿主基因组和病毒基因组进行比对，并确定同源性高风险区域，以便对所述候选编码区序列进行同源性风险评分；和基于所述同源性风险评分，在所述候选编码区序列集合中确定优选编码区序列子集。 |
