一种用于构建细菌16S rDNA全长高通量测序文库的方法专利查询专利号|摘要-满商公司网

一种用于构建细菌16S rDNA全长高通量测序文库的方法

基本信息

申请号	CN201910260280.2	申请日	-
公开（公告）号	CN110004210A	公开（公告）日	2019-07-12
申请公布号	CN110004210A	申请公布日	2019-07-12
分类号	C12Q1/6806;C12Q1/6869;C40B50/06	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	陈祖耕;毕书琳;王成	申请（专利权）人	杭州进一生物科技有限公司
代理机构	杭州千克知识产权代理有限公司	代理人	杭州进一生物科技有限公司
地址	310000 浙江省杭州市经济技术开发区白杨街道6号大街452号2幢D1301-1309房
法律状态	-

摘要

本发明涉及一种用于构建细菌16S rDNA全长高通量测序文库的方法，涉及微生物高通量测序领域。该方法首先将随机碱基组成的特异性标签序列(UMI)加在每个16S rDNA模板分子两端，经PCR扩增得到多个拷贝的两端含特定UMI的16S rDNA全长扩增子，通过随机打断并连接上测序文库的接头，经双端测序获得UMI序列和相应的16S rDNA片段序列；另外，通过环化16S rDNA全长扩增子和测序，获得同一分子两端的UMI配对信息；根据相同UMI和配对UMI信息进行reads的组装，从而增加拼接长度，最终组装得到16S rDNA全长序列信息。本发明提供的方法成本低、准确度高，适用于高通量测序平台；同时该方法通过UMI可有效排除PCR扩增偏好性、扩增错误和测序错误的影响，从而更加精确地定量样本中的细菌种群丰度。