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一种高密度遗传图谱的构建方法

基本信息

申请号 CN201710804279.2 申请日 -
公开（公告）号 CN107644150B 公开（公告）日 2021-03-19
申请公布号 CN107644150B 申请公布日 2021-03-19
分类号 G16B40/00(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I 分类 物理
发明人 蔡庆乐;唐耀华;何荣军 申请（专利权）人 杭州和壹基因科技有限公司
代理机构 杭州中成专利事务所有限公司 代理人 唐银益
地址 310051浙江省杭州市滨江区长河街道聚才路88号远方科技中心15楼
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种高密度遗传图谱的构建方法，步骤是1)根据遗传分离群体高通量测序数据中得到的SNP标记，对标记进行基因型分型和过滤，再计算两两之间的重组率；2)利用步骤1)算得的重组率，采用分层聚类算法根据前述遗传分离群体的染色体数对SNP标记进行分组，得到与染色体数对应的连锁群；3)采用最小生成树算法对标记进行排序，对排序后的SNP标记进行补缺失和纠错处理，最后计算遗传距离得到遗传图谱。本发明针对不同的遗传分离群体高效、高准确率的构建遗传图谱，为后续的生物信息学分析和遗传学研究提供有力支持。