一种鉴别东北地区黄芩的SSR分子标记引物及方法

基本信息

申请号 CN202011048452.9 申请日 -
公开(公告)号 CN113684291A 公开(公告)日 2021-11-23
申请公布号 CN113684291A 申请公布日 2021-11-23
分类号 C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 王继永;郑司浩;曾燕;刘美娟;尚兴朴;梁焕;赵莎;王浩;李九如;高强;静一;刘国城;孙文静 申请(专利权)人 中国中药有限公司
代理机构 北京知联天下知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 张陆军;张迎新
地址 100195 北京市海淀区西四环北路15号依斯特大厦8层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供一种鉴别东北地区黄芩的SSR分子标记引物及方法,方法包括如下步骤:以待鉴定黄芩样本的总DNA为模板,用SSR分子标记引物进行PCR扩增,得到扩增产物;对扩增产物进行毛细管电泳测序分型,得到扩增产物的分型结果;将扩增产物的分型结果用GeneMarker4.0进行峰图判读,得到等位基因矩阵;根据等位基因矩阵,通过GenALEx计算黄芩的遗传多样性数据;基于GenALEx计算所得的遗传多样性数据,通过MEGA进行UPGMA聚类分析,构建聚类树。本发明应用基因组技术及SSR分子标记技术,利用黄芩基因组设计SSR引物,并通过河北、山西、山东、陕西、内蒙古、辽宁、吉林等地的黄芩样本筛选SSR引物,用于特异性鉴别东北地区黄芩样本,准确度高、稳定性强、易于大范围推广应用。