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用于在基因芯片中将外显子探针信号值转化为转录本结构与浓度的方法

基本信息

申请号 CN201310284395.8 申请日 -
公开（公告）号 CN104112083B 公开（公告）日 2016-11-09
申请公布号 CN104112083B 申请公布日 2016-11-09
分类号 G06F19/16 分类 计算；推算；计数;
发明人 王效智;李奇 申请（专利权）人 上海其明信息技术有限公司
代理机构 北京金信知识产权代理有限公司 代理人 刘锋;黄小栋
地址 201210 上海市浦东新区张江路665号907室
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种用于在基因芯片中将外显子探针信号值转化为转录本结构与浓度的方法，包括以下步骤：S100，对该多个探针的初始信号值进行处理，获得转录本和探针的初始结构关系矩阵以及转录本和样本的初始浓度关系矩阵；S200，从已知转录本数据库中分别选取与该初始结构关系矩阵内每个结构关系数列阶梯距离最短的最小阶梯距离标准数列；S300，确定各该结构关系数列的最近似标准数列；S400，根据各该结构关系数列的最近似标准数列，将该初始浓度关系矩阵调整为最终的预测浓度关系矩阵。通过本发明得出的转录本结构和浓度与实验验证结果具有很好的一致性，并可为后续试验提供可靠参考。