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全细胞蛋白和基因相互作用网络分析系统

基本信息

申请号	CN201010202475.0	申请日	-
公开（公告）号	CN102289432A	公开（公告）日	2011-12-21
申请公布号	CN102289432A	申请公布日	2011-12-21
分类号	G06F17/30(2006.01)I	分类	计算；推算；计数;
发明人	苏峰;李奇;李睿	申请（专利权）人	上海其明信息技术有限公司
代理机构	-	代理人	-
地址	201210 上海市浦东新区张江路725号7楼C座
法律状态	-

摘要

本发明是一种全细胞蛋白和基因相互作用网络，属于生物学和计算机数据库技术相结合的领域。目前常用的蛋白间相互作用数据来自于KEGG(京都基因与基因组百科全书)，然而，该数据库将细胞内不同功能的信号通路分别构建网络，人为地割裂了全细胞范围的相互作用网络。本发明将解析KEGG数据库，将KEGG数据库的多种功能间相互做关系连通，并连接了所有常用蛋白相互作用数据库，共同构筑了全细胞网络分析系统。Signal-Net解构了KEGG数据库，突破了KEGG-Pathway数据库中基因间相互作用关系局限于某一Pathway的限制。因此，Signal-Net在全KEGG-Pathway数据库的范围内筛选某个蛋白的上游或下游蛋白。在此，本发明将满足数据筛选条件的基因分别构建实验组和对照组基因网络。