一种基于粪便微生物标志物和人DNA含量的结直肠癌风险评估的方法及应用
基本信息
| 申请号 | CN202010118005.X | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113314211A | 公开（公告）日 | 2021-08-27 |
| 申请公布号 | CN113314211A | 申请公布日 | 2021-08-27 |
| 分类号 | G16H50/20（2018.01）I;G16H50/30（2018.01）I;G16B40/00（2019.01）I;G16B30/00（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 陈卫华;江浦滋;罗奇斌 | 申请（专利权）人 | 深圳市奇云生物信息科技有限公司 |
| 代理机构 | - | 代理人 | - |
| 地址 | 518055广东省深圳市南山区西丽街道办牛城路217号-26 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明涉及医疗筛查领域，且公开了一种基于粪便微生物标志物和人DNA含量的结直肠癌风险评估的方法及应用，包括人体肠道微生物在线数据库的构建、数据预处理、相关通路丰度鉴定、机器学习模型的建立、真实样本应用。以相关DNA含量作为衡量对象，增加测量的全面性，同时利用多个数据集通过荟萃（Meta）分析，所得到的差异菌群、差异通路具有很强的跨人种适用性，除了根据微生物群落的变化，还可以根据代谢网络的变化来预测受试者肠道健康状况，并通过机器学习模型对肠道微生物和粪便中人类DNA含量进行计算，使得整个流程更加实用和精确，保证计算结果的准确性，该综合粪便人类DNA信息与粪便菌群标志物的预测风险模型，只需要采粪便样本并进行宏基因组测序就可以得到两者的信息，而不需要结合其他检测，依存性强，同时所选取的实验载体粪便是临床使用和体检机构中最常见的，获取难度小成本低，解释程度高。 |
