一种微生物基因数据库的构建方法及系统

基本信息

申请号 CN202111443169.0 申请日 -
公开(公告)号 CN114121167B 公开(公告)日 2022-07-01
申请公布号 CN114121167B 申请公布日 2022-07-01
分类号 G16B50/30(2019.01)I;G16B50/10(2019.01)I 分类 物理
发明人 徐晓强;夏炎;王晓凯;谢海亮 申请(专利权)人 深圳零一生命科技有限责任公司
代理机构 杭州信与义专利代理有限公司 代理人 -
地址 518000广东省深圳市宝安区福永云创孵化器26栋3层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种微生物基因数据库的构建方法及系统,属于基因数据库构建技术领域。所述方法包括以下步骤:获取目标微生物基因组数据,对获取的基因组数据进行基因预测,获得包含序列和物种注释的基因注释文件;获得每种目标微生物的代表基因;将所述代表基因中的每个基因分别比对到核酸序列数据库,获得比对结果;过滤比对结果,获得基因注释物种信息,保留注释物种与来源物种相同的基因,进而构建所述微生物基因数据库。利用本发明的构建方法构建微生物基因数据库,可以根据目标微生物的变化对数据库进行更新,实时性更强,利用本发明构建的微生物数据库,仅包含目标微生物基因序列,对比时间更短。