一种无参考基因组的群体变异检测分析方法
基本信息
| 申请号 | CN202011596548.9 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN112735516A | 公开（公告）日 | 2021-04-30 |
| 申请公布号 | CN112735516A | 申请公布日 | 2021-04-30 |
| 分类号 | G16B20/20;G16B40/00 | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 徐昊;姜丽荣;孙子奎 | 申请（专利权）人 | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
| 代理机构 | 上海点威知识产权代理有限公司 | 代理人 | 胡志强 |
| 地址 | 200030 上海市徐汇区银都路218号2号楼3、4层 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开了一种无参考基因组的群体变异检测分析方法，1)通过dd‑RAD的方法进行样本测序，测序后得到每个样本的数据使用flash软件包将有overlap的read1与read2连接起来，通过聚类软件对每个样本的序列聚类，提取每个样本序列中的consensus序列；2)将步骤1)得到的每个样本序列的consensus序列合并，然后进行聚类，过滤，得到群体的consensus序列，通过本发明使无参考基因组的群体进化分析更加高效，可以极大提高变异检测的速度和准确度。 |
