一种用于鉴定样品中幽门螺杆菌的细菌分型和耐药类型的二代测序建库方法

基本信息

申请号 CN201910751812.2 申请日 -
公开(公告)号 CN110453000A 公开(公告)日 2019-11-15
申请公布号 CN110453000A 申请公布日 2019-11-15
分类号 C12Q1/689;C12Q1/6806;C40B50/06 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 覃俊杰 申请(专利权)人 深圳谱元科技有限公司
代理机构 深圳市精英专利事务所 代理人 李翔宇
地址 518000广东省深圳市福田区福保街道福保社区市花路南侧长富金茂大厦1号楼2103
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种用于鉴定样品中幽门螺杆菌的细菌分型和耐药类型的二代测序建库方法,包括步骤S1,引物的设计和筛选,根据待测靶基因设计特异性引物;步骤S2,合成通用引物对;步骤S3,合成过渡性引物对;步骤S4,合成建库引物对;步骤S5,基因组的提取;步骤S6,在PCR扩增体系中加入所有的特异性引物对进行第一轮的多重扩增,回收产物并稀释,作为下一轮多重扩增的模板;步骤S7,在PCR扩增体系中加入通用引物对和所有的过渡性引物对进行第二轮的多重扩增,回收产物并稀释,作为下一轮多重扩增的模板;步骤S8,在PCR扩增体系中加入建库引物对进行第三轮的建库扩增,回收产物,获得制备完毕的文库;步骤S9,NGS靶基因测序;步骤S10,NGS分析。