一种基于SOLID测序技术的基因SNP位点检测方法专利查询专利号|摘要-满商公司网

一种基于SOLID测序技术的基因SNP位点检测方法

基本信息

申请号	CN201310351267.0	申请日	-
公开（公告）号	CN103451279B	公开（公告）日	2015-02-18
申请公布号	CN103451279B	申请公布日	2015-02-18
分类号	C12Q1/68(2006.01)I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	邓彦;王月兰;倪受庸;刘新华	申请（专利权）人	北京华生恒业科技有限公司
代理机构	-	代理人	-
地址	224007 江苏省盐城市经济技术开发区希望大道南路5号4幢14楼
法律状态	-

摘要

本发明属于生物工程领域，尤其涉及一种基于SOLiD测序的SNP位点检测方法。其具体步骤如下：（1）通过SOLiD测序获得待测基因样本的颜色序列；（2）预备参考序的颜色序列；（3）制备颜色编码参考序的索引表以备快速定位样本序；（4）将SOLID测序样本序和颜色编码参考序进行比对，找出样本序在参考序中的最佳匹配位置；比对样本序与参考序，获取颜色编码匹配信息；（5）根据颜色编码的匹配信息，分析SOLiD样本序与颜色编码的参考序的碱基匹配信息，确定不确定变异点；（6）统计获得的不确定变异点，去除噪声和测序错误导致的不确定变异点，从而获得样本SNP位点。采用本发明的SNP检测方法，既保持了SOLID数据在比对过程中定位准确度高的特性，又提高了分析SNP方法的准确度。