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一种基于单细胞测序数据唯一片段序列捕获方法

基本信息

申请号	CN202011200039.X	申请日	-
公开（公告）号	CN112309500A	公开（公告）日	2021-02-02
申请公布号	CN112309500A	申请公布日	2021-02-02
分类号	G16B30/00(2019.01)I;	分类	物理
发明人	潘星华;林贯川;黄仲曦;章建平	申请（专利权）人	广州序科码生物技术有限责任公司
代理机构	广州三环专利商标代理有限公司	代理人	颜希文
地址	510530广东省广州市高新技术产业开发区科学城开源大道11号B3栋905室
法律状态	-

摘要

本发明提供了一种基于单细胞测序数据捕获唯一片段序列的方法，其特征在于，包括以下步骤：基于单细胞测序文库中的DNA片段，以DNA片段上前10bp‑20bp碱基作为识别序列，对含有相同所述识别序列的DNA片段进行归类，通过计算机软件将同类型的DNA片段生成一个数据集，从该数据集获得用于分析单细胞全基因组唯一序列。本发明使用生物信息学手段进行数据识别，使得在基因组建库过程中无需设计和通过实验插入含有UMI的固有接头序列，简化了单细胞测序过程，并缩短了时间和降低因接头序列过长所导致的引物二聚体形成的发生概率。本方法在测序数据分析之前即可去除重复的序列，对于拷贝数变异分析而言，无其它相同的序列混杂，只剩下唯一的序列片段，即可更忠实的反应基因组的情况。