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一种基于高通量测序的建库方法

基本信息

申请号	CN202010094903.6	申请日	-
公开（公告）号	CN111321208A	公开（公告）日	2020-06-23
申请公布号	CN111321208A	申请公布日	2020-06-23
分类号	C12Q1/6869(2018.01)I	分类	生物化学；啤酒；烈性酒；果汁酒；醋；微生物学；酶学；突变或遗传工程;
发明人	吴渊;毕书琳;李旭超;李健鹏;周文刚;郑方克;郑立谋	申请（专利权）人	上海厦维医学检验实验室有限公司
代理机构	厦门市首创君合专利事务所有限公司	代理人	上海厦维生物技术有限公司;上海厦维医学检验实验室有限公司
地址	200000上海市闵行区新骏环路138号3幢201,202室
法律状态	-

摘要

本发明公开了一种基于高通量测序的建库方法。该方法适用于片段化后的基因组DNA/FFPE RNA/cfDNActDNA等核苷酸样本。进一步将核苷酸样本片段进行修饰与变性、接头连接，再通过对目标区进行两次特异性PCR反应富集，可得到测序文库。对上述测序文库进行质控和定量分析，可进行高通量测序。本发明还提供了一种模拟双链连接接头。该建库方法简单方便，保留了基于扩增子的多重PCR建库方法的优点，同时可以用于检测未知融合，尤其适用于片段化程度较高的核苷酸样本(例如cfDNA/ctDNA样本)，对于存在损伤的DNA分子也可以用于建库，本发明方法能够最大程度保留所有原始核苷酸信息，且使用该方法进行RNA建库时不需要进行二连合成操作。