一种基因组测序数据序列组装方法

基本信息

申请号 CN201410177319.1 申请日 -
公开(公告)号 CN104751015B 公开(公告)日 2017-08-29
申请公布号 CN104751015B 申请公布日 2017-08-29
分类号 G06F19/18(2011.01)I 分类 计算;推算;计数;
发明人 孙际宾;李澎鹏;郑平;马延和 申请(专利权)人 天工生物科技(天津)有限公司
代理机构 天津滨海科纬知识产权代理有限公司 代理人 韩敏
地址 300308 天津市滨海新区自贸试验区(空港经济区)中环西路86号汇盈产业园8号楼1-201-A218
法律状态 -

摘要

摘要 本发明实施例提供了一种基因组测序数据序列组装方法,可以简便而准确地实现基因组测序数据序列的组装。该方法包括:根据序列片段之间的重叠关系,构建重叠关系图G以及反向互补图G’;任取重叠关系图G中的未被检查过的节点nx,以任意方向D遍历G和G’;判断任意方向D中是否存在一节点ny与节点nx有连接关系;如果存在,则继续判断在方向D中的节点ny与节点nx是否为双向唯一关系;当所述节点ny与节点nx为双向唯一关系时,将所述节点ny与nx的关系判定为可信连接关系;否则,将所述节点ny与nx的所有关系判定为不确认连接关系。