一种ctDNA测序标签接头、文库、检测方法和试剂盒
基本信息
| 申请号 | CN202110458794.6 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113373524A | 公开（公告）日 | 2021-09-10 |
| 申请公布号 | CN113373524A | 申请公布日 | 2021-09-10 |
| 分类号 | C40B70/00（2006.01）I;C40B80/00（2006.01）I;C40B40/06（2006.01）I;C12Q1/6869（2018.01）I;G16B30/00（2019.01）I | 分类 | 组合技术〔8〕; |
| 发明人 | 邵阳;吴雪;汪笑男;常志力;包华;张秀艳 | 申请（专利权）人 | 南京世和基因生物技术股份有限公司 |
| 代理机构 | 南京正联知识产权代理有限公司 | 代理人 | 邓唯 |
| 地址 | 210032江苏省南京市高新开发区新锦湖路3-1号中丹生态生命科学产业园02栋18楼 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本发明公开一种利用NGS技术检测血浆ctDNA超低频突变的测序方法及分子标签接头。标签接头包括含有11个碱基的样本标签和含有4个碱基的单分子及双链DNA共用标签序列。样本标签实现了超过300种i7/i5“双端唯一”index组合，分子标签可同时用作单分子和双链分子index。采用本发明提供的标签接头，可以有效去除文库富集过程中DNA氧化应激损伤、PCR扩增以及测序引入的随机错误突变；同时能够有效识别发生“标签跳跃”的分子，避免因标签跳跃造成样本间交叉污染引入的假性突变。本发明在保证100%特异性的前提下实现了检测灵敏度的大力提升，ctDNA中丰度0.1%突变的检测敏感性达到95%以上。 |
