一种NGS测序中样本质量预测方法及系统
基本信息
申请号 | CN202110757007.8 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN113528631A | 公开(公告)日 | 2021-10-22 |
申请公布号 | CN113528631A | 申请公布日 | 2021-10-22 |
分类号 | C12Q1/6869(2018.01)I;G16B5/00(2019.01)I;G16B25/20(2019.01)I | 分类 | 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程; |
发明人 | 何俊俊;邵阳;刘凯华;朱伟;高宇;杨岚;汪笑男;王晓丹;焦乐晨;赵瑾 | 申请(专利权)人 | 南京世和基因生物技术股份有限公司 |
代理机构 | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 | 代理人 | 邹仕娟 |
地址 | 210032江苏省南京市高新开发区新锦湖路3-1号中丹生态生命科学产业园02栋18楼 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明涉及一种通过肿瘤组织样本NGS前期实验指标预测质控是否合格的模型和软件,属于临床检验学和生物技术领域。通过提取和预文库构建过程第一天的实验指标,筛选出与质控相关的因素,通过岭回归的方法,以NGS实验流程前期的指标建立NGS质控预测模型。对于预测为质控不合格的样本及时告知患者,有效的解决患者测序生信分析后才知道自己样本不合格再重新准备的问题。将模型通过PYTHON编译并打包成小软件,实验员通过界面输入相关实验指标来预测该样本质控是否合格,适用于预测样本测序后的质控风险评估。 |
