预测siRNA针对某类细胞的毒性的机器学习模型的建立方法及其应用
基本信息
| 申请号 | CN201611121663.4 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN108182346B | 公开（公告）日 | 2021-07-30 |
| 申请公布号 | CN108182346B | 申请公布日 | 2021-07-30 |
| 分类号 | G16B40/00（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 蔡金露;钟南;张庆勇;金盈 | 申请（专利权）人 | 杭州康万达医药科技有限公司 |
| 代理机构 | 北京天昊联合知识产权代理有限公司 | 代理人 | 王静;丁业平 |
| 地址 | 311121浙江省杭州市余杭区文一西路998号未来科技城18号楼511-512室 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 提供了预测siRNA对某类细胞的毒性的机器学习模型的建立方法及应用。该方法包括A）提供n条19‑29bp的siRNA，n≥2；B）获得每条siRNA用于建立该模型的输入值和输出值；输入值如此得到：i）将siRNA与基因组mRNA比对，选择互补且错配碱基数小于等于7的脱靶基因；ii）根据互补区中错配碱基特征及mRNA二级结构，得到脱靶权重；iii）用数据库得到脱靶基因的组学权重；iv）基于所有脱靶基因的组学权重和脱靶权重，计算组学特征值作为输入值；输出值如此得到：用siRNA进行细胞实验，获得siRNA下的细胞生存指数作为输出值；C）将n条siRNA的输入值和输出值通过机器学习算法进行计算。 |
