一种基于高性能计算平台的核酸适配体计算机辅助筛选方法及核酸适配体

基本信息

申请号 CN201910379241.4 申请日 -
公开(公告)号 CN110111849B 公开(公告)日 2021-03-26
申请公布号 CN110111849B 申请公布日 2021-03-26
分类号 G16B50/00(2019.01)I;G16B30/00(2019.01)I 分类 物理
发明人 刘彤;屈锋;裴智勇;刘书霞;陆晓娟;刘满姣;袁寒玉;杨杰 申请(专利权)人 北京市计算中心有限公司
代理机构 - 代理人 -
地址 100094北京市东城区东四南大街249号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种基于高性能计算平台的核酸适配体计算机辅助筛选方法,涉及分子生物学检测技术领域,根据匹配原则查询筛选平台集成的数据库系统中是否有与目标蛋白匹配的蛋白结构,如果有则作为受体模板,如果没有则进行同源构建,通过分子动力学模拟和分子对接筛选得到初选的核酸适配体,最为核酸适配体候选物,具有高效、快捷、准确率高的特点。该筛选方法可与“湿法”实验结合,减少“湿法”实验次数,节省实验成本,提高筛选成功率。通过计算机辅助模拟分析得到适配过程中蛋白质与核酸分子间化学反应机理等信息,并将数据在终端进行展示,并在揭示相应生物材料与核酸分子间可能的相互作用机理方面提供数据支撑,因此具有重要的研究意义和使用价值。