抗原特异性TCR数据库的建立方法及抗原特异性TCR的评估方法
基本信息
申请号 | CN202010828988.6 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN112133372A | 公开(公告)日 | 2020-12-25 |
申请公布号 | CN112133372A | 申请公布日 | 2020-12-25 |
分类号 | G16B50/00(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 任树成;宋瑾;梅博源;张恒辉;沈宁 | 申请(专利权)人 | 北京臻知医学科技有限责任公司 |
代理机构 | 北京中珒知识产权代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人 | 北京臻知医学科技有限责任公司 |
地址 | 102600北京市大兴区中关村科技园区大兴生物医药产业基地宝参南街16号院2号楼2层201-2 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开一种抗原特异性TCR数据库的建立方法及抗原特异性TCR的评估方法,其中该建立方法包括:采集T细胞样本,分离出T细胞样本中的特异性T细胞克隆;对特异性T细胞克隆进行测序,获得特异性T细胞克隆的CDR3β序列信息;对特异性T细胞克隆进行过滤处理;修剪特异性T细胞克隆的CDR3β区域的序列,得到第一类特异性T细胞克隆;通过TCR公共数据库获取其中的序列,对序列进行可信度评分;选取可信度评分大于预设值的序列,修剪其CDR3β区域的序列,得到第二类特异性T细胞克隆;根据第一类特异性T细胞克隆和第二类特异性T细胞克隆建立抗原特异性TCR数据库。通过本发明实施例建立的数据库可作为抗原特异性TCR分析的参考数据库。 |
