抗原特异性TCR数据库的建立方法及抗原特异性TCR的评估方法

基本信息

申请号 CN202010828988.6 申请日 -
公开(公告)号 CN112133372A 公开(公告)日 2020-12-25
申请公布号 CN112133372A 申请公布日 2020-12-25
分类号 G16B50/00(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I 分类 物理
发明人 任树成;宋瑾;梅博源;张恒辉;沈宁 申请(专利权)人 北京臻知医学科技有限责任公司
代理机构 北京中珒知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 代理人 北京臻知医学科技有限责任公司
地址 102600北京市大兴区中关村科技园区大兴生物医药产业基地宝参南街16号院2号楼2层201-2
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开一种抗原特异性TCR数据库的建立方法及抗原特异性TCR的评估方法,其中该建立方法包括:采集T细胞样本,分离出T细胞样本中的特异性T细胞克隆;对特异性T细胞克隆进行测序,获得特异性T细胞克隆的CDR3β序列信息;对特异性T细胞克隆进行过滤处理;修剪特异性T细胞克隆的CDR3β区域的序列,得到第一类特异性T细胞克隆;通过TCR公共数据库获取其中的序列,对序列进行可信度评分;选取可信度评分大于预设值的序列,修剪其CDR3β区域的序列,得到第二类特异性T细胞克隆;根据第一类特异性T细胞克隆和第二类特异性T细胞克隆建立抗原特异性TCR数据库。通过本发明实施例建立的数据库可作为抗原特异性TCR分析的参考数据库。