一种用于宏基因组学病原体检测参考阈值建立的方法

基本信息

申请号 CN202110895536.4 申请日 -
公开(公告)号 CN113571128A 公开(公告)日 2021-10-29
申请公布号 CN113571128A 申请公布日 2021-10-29
分类号 G16B20/00(2019.01)I;G16B25/20(2019.01)I;G16B30/10(2019.01)I;G16B40/00(2019.01)I;C12Q1/6869(2018.01)I;C12Q1/04(2006.01)I 分类 物理
发明人 申奥;吴红龙 申请(专利权)人 华大生物科技(武汉)有限公司
代理机构 北京纪凯知识产权代理有限公司 代理人 张立娜
地址 518052广东省深圳市前海深港合作区南山街道临海大道59号海运中心口岸楼0605A房
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开了一种用于宏基因组学病原体检测参考阈值建立的方法。该方法包括:确定临床样本类型;确定其组成成分及人源细胞含量分布范围;设置梯度阴性对照;对阴性对照样本按照待测临床样本即将进行的宏基因组检测流程进行多批次重复测试;统计不同人源细胞浓度的阴性对照样本中不同病原体的检测序列数,得到对应病原体在不同人源细胞浓度的阴性对照样本的检测序列数波动区间;以对应病原体在阴性对照样本中的检测序列数波动区间上限的120%为阈值。本发明能实现样本检测结果分层判别,提高宏基因组学病原检测结果准确性;可提高报告解读效率;可有效减少宏基因组检测结果的假阳性;可实时评估检测流程中的污染,指导实验室流程改进。