用于衡量基因组不稳定性的检测方法、设备、终端设备和计算机可读存储介质

基本信息

申请号 CN202011360888.1 申请日 -
公开(公告)号 CN112669906B 公开(公告)日 2021-09-28
申请公布号 CN112669906B 申请公布日 2021-09-28
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B20/30(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I;G06K9/62(2006.01)I 分类 物理
发明人 焦阳;孟培;王春丽;陈冬菊;蔡宇航;邵明辉;宋程程;石太平 申请(专利权)人 华大生物科技(武汉)有限公司
代理机构 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 周慧云
地址 518083广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了用于衡量基因组不稳定性的检测方法,包括:(1)获取测序数据;(2)确定BAF数值和LRR数值;(3)进行离群点去除;(4)至少一轮分段处理;(5)断点集合合并;(6)对二级分选片段进行合并处理;(7)对三级分选片段进行过滤和切割处理,(8)同分布检验;(9)确定BAF均值,拷贝数均值;(10)对四级分选片段的BAF均值、拷贝数均值百分比序数进行平面坐标轴聚类作图,以便确定待测样本中肿瘤样本的肿瘤纯度;(11)确定待测样本的倍性校正因子;(12)进行BAF数值校正和拷贝数校正;(13)确定A基因型参数值和B基因型参数值;(14)确定变异类型。