用于衡量基因组不稳定性的检测方法、设备、终端设备和计算机可读存储介质
基本信息
申请号 | CN202011360888.1 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN112669906A | 公开(公告)日 | 2021-04-16 |
申请公布号 | CN112669906A | 申请公布日 | 2021-04-16 |
分类号 | G16B30/10;G16B20/30;G16B20/20;G06K9/62 | 分类 | 物理 |
发明人 | 焦阳;孟培;王春丽;陈冬菊;蔡宇航;邵明辉;宋程程;石太平 | 申请(专利权)人 | 华大生物科技(武汉)有限公司 |
代理机构 | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人 | 周慧云 |
地址 | 518083 广东省深圳市盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供了用于衡量基因组不稳定性的检测方法,包括:(1)获取测序数据;(2)确定BAF数值和LRR数值;(3)进行离群点去除;(4)至少一轮分段处理;(5)断点集合合并;(6)对二级分选片段进行合并处理;(7)对三级分选片段进行过滤和切割处理,(8)同分布检验;(9)确定BAF均值,拷贝数均值;(10)对四级分选片段的BAF均值、拷贝数均值百分比序数进行平面坐标轴聚类作图,以便确定待测样本中肿瘤样本的肿瘤纯度;(11)确定待测样本的倍性校正因子;(12)进行BAF数值校正和拷贝数校正;(13)确定A基因型参数值和B基因型参数值;(14)确定变异类型。 |
