用于选择性全基因组扩增的引物设计方法、装置及应用
基本信息
| 申请号 | CN202010356271.6 | 申请日 | - |
| 公开（公告）号 | CN113571123A | 公开（公告）日 | 2021-10-29 |
| 申请公布号 | CN113571123A | 申请公布日 | 2021-10-29 |
| 分类号 | G16B15/30（2019.01）I | 分类 | 物理 |
| 发明人 | 李英镇;林宇锋;李晴晴 | 申请（专利权）人 | 华大生物科技（武汉）有限公司 |
| 代理机构 | 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 | 代理人 | 李小焦;彭家恩 |
| 地址 | 510006广东省广州市番禺区大学城小谷围街青蓝街22号国家数字家庭产业应用示范基地B区3楼华大基因 | ||
| 法律状态 | - | ||
摘要
| 摘要 | 本申请公开了一种用于选择性全基因组扩增的引物设计方法、装置及应用。本申请的方法包括，引物设计参数设置步骤，预先设置引物长度、引物组合个数，引物组合在目标基因或背景基因的平均距离、最大距离、分布均匀性；引物设计步骤，利用k‑mer在背景基因与目标基因中的差异设计引物；引物组合筛选步骤，输出最优的N个引物组合；引物组合测评步骤，模拟各引物组合对各目标基因的覆盖率，预计可能丢失的区域；结果分析步骤，输出每组实验的目标基因组覆盖率和深度图，以便根据实验情况筛选引物组合。本申请的方法，可设计能同时富集多个目标基因的引物组合，能有效提高目标基因覆盖度，在同等条件下比现有的引物设计流程缩短约80％的时间。 |
