CYP21A2基因NGS数据分析的方法、装置及应用

基本信息

申请号 CN202111057946.8 申请日 -
公开(公告)号 CN113724791A 公开(公告)日 2021-11-30
申请公布号 CN113724791A 申请公布日 2021-11-30
分类号 G16B30/10(2019.01)I;G16B20/50(2019.01)I;G16B20/30(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I 分类 物理
发明人 刘风侠;孙隽;周梅珍;许莹硕;樊春娜;王垚燊;彭智宇 申请(专利权)人 华大生物科技(武汉)有限公司
代理机构 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 代理人 李小焦;彭家恩
地址 300000天津市天津自贸区(空港经济区)环河北路80号空港商务园东区3号楼201-1室
法律状态 -

摘要

摘要 本申请公开了一种CYP21A2基因NGS数据分析的方法、装置及应用。本申请方法包括,对芯片捕获区域设定窗口和滑动窗口,根据每个窗口深度及GC含量进行深度修正,对修正后的深度,根据隐马模型计算各窗口拷贝数;统计CYP21A2基因区域序列,挑选成对序列,根据成对序列区间内目标位点和辅助位点位置,判定目标位点和辅助位点的碱基,对照参考序列目标位点真假基因处碱基,判定该成对序列支持真基因突变或未突变;利用待测样本拷贝数校正的值,对照每个位点设定阈值,确定小于阈值的样本为突变候选样本;综合以上结果,添加各样本突变位点数提示CNV,获得CYP21A2基因的CNV和点突变结果。本申请方法,利用高通量测序数据能准确有效的获得CYP21A2基因的拷贝数变异和点突变信息。