结核分枝杆菌多线耐药基因鉴定的方法和装置

基本信息

申请号 CN202010382675.2 申请日 -
公开(公告)号 CN113621716A 公开(公告)日 2021-11-09
申请公布号 CN113621716A 申请公布日 2021-11-09
分类号 C12Q1/689(2018.01)I;C12N15/11(2006.01)I;G16B30/10(2019.01)I;G16B20/20(2019.01)I 分类 生物化学;啤酒;烈性酒;果汁酒;醋;微生物学;酶学;突变或遗传工程;
发明人 毛宛司;谢植豪;袁剑颖;李英镇 申请(专利权)人 华大生物科技(武汉)有限公司
代理机构 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 代理人 彭家恩;罗瑶
地址 518057广东省深圳市南山区粤海街道高新区社区高新南四道025号高新工业村W2A栋、B栋A栋201203A5
法律状态 -

摘要

摘要 一种结核分枝杆菌多线耐药基因鉴定的方法和装置,该方法包括:获取样本的宏基因组测序得到的全基因组序列或基于靶向扩增测序得到的结核分枝杆菌耐药靶标区域的序列并进行数据质控;将数据质控后的序列比对到结核分枝杆菌基因组上,进行排序并筛选出符合质量要求的比对结果;将比对位置位于结核分枝杆菌耐药基因数据库中的变异位点所在的基因区域的序列进行局部组装并进行变异检测;将变异检测的结果,根据变异位点在基因组上的位置和突变类型,注释到结核分枝杆菌耐药基因数据库上;基于注释结果输出结核分枝杆菌耐药基因数据库中每个药物耐药相关突变位点的检测结果。本发明能够在一次检测中覆盖多种药物及其对应的耐药位点,检测精度高。