基于RNA靶向测序和机器学习的癌症亚型分型方法及装置

基本信息

申请号 CN201910783893.4 申请日 -
公开(公告)号 CN110400601A 公开(公告)日 2019-11-01
申请公布号 CN110400601A 申请公布日 2019-11-01
分类号 G16B20/00(2019.01)I; C12Q1/6869(2018.01)I 分类 物理
发明人 杨家亮; 王博; 郎继东; 梁乐彬; 张燕香; 孙雪; 王伟伟; 王兴枝; 时淑舫; 田埂 申请(专利权)人 元码基因科技(无锡)有限公司
代理机构 北京北汇律师事务所 代理人 元码基因科技(无锡)有限公司
地址 214000 江苏省无锡市锡山区安镇街道丹山路88号锡东创融大厦C座208
法律状态 -

摘要

摘要 本发明公开基于RNA靶向测序和机器学习的癌症亚型分型方法及装置。本发明通过RNA靶向测序技术,高效富集目标基因区域,经过反转录、建库、测序步骤,得到目标区域的二代测序数据,并利用随机森林算法在TCGA数据集上训练得到肿瘤分型预测模型,从而准确地进行癌症多亚型分型。基于本发明的方法得到能够高准确率对肺癌和肾细胞癌分型模型。本发明的方法能够降低分型成本,而且分型速度、精度、分析结果的准确率上均超过传统方法。