基于RNA靶向测序和机器学习的癌症亚型分型方法及装置
基本信息
申请号 | CN201910783893.4 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN110400601A | 公开(公告)日 | 2019-11-01 |
申请公布号 | CN110400601A | 申请公布日 | 2019-11-01 |
分类号 | G16B20/00(2019.01)I; C12Q1/6869(2018.01)I | 分类 | 物理 |
发明人 | 杨家亮; 王博; 郎继东; 梁乐彬; 张燕香; 孙雪; 王伟伟; 王兴枝; 时淑舫; 田埂 | 申请(专利权)人 | 元码基因科技(无锡)有限公司 |
代理机构 | 北京北汇律师事务所 | 代理人 | 元码基因科技(无锡)有限公司 |
地址 | 214000 江苏省无锡市锡山区安镇街道丹山路88号锡东创融大厦C座208 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明公开基于RNA靶向测序和机器学习的癌症亚型分型方法及装置。本发明通过RNA靶向测序技术,高效富集目标基因区域,经过反转录、建库、测序步骤,得到目标区域的二代测序数据,并利用随机森林算法在TCGA数据集上训练得到肿瘤分型预测模型,从而准确地进行癌症多亚型分型。基于本发明的方法得到能够高准确率对肺癌和肾细胞癌分型模型。本发明的方法能够降低分型成本,而且分型速度、精度、分析结果的准确率上均超过传统方法。 |
