一种基于Primer3的bPrimer批量PCR引物设计方法

基本信息

申请号 CN201610089004.0 申请日 -
公开(公告)号 CN105718759B 公开(公告)日 2018-09-25
申请公布号 CN105718759B 申请公布日 2018-09-25
分类号 G06F19/20 分类 计算;推算;计数;
发明人 戴立忠;彭厘旻;郭鑫武;陈明;王煜;罗喜鹏 申请(专利权)人 湖南圣维基因科技有限公司
代理机构 北京弘权知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人 逯长明;许伟群
地址 410600 湖南省长沙市岳麓区高新技术产业开发区麓松路680号
法律状态 -

摘要

摘要 本发明提供了一种基于Primer3的bPrimer批量PCR引物设计方法,所述方法包括:获取目标DNA序列的原始序列;提取DNA多态性数据中的高频多态性位点;对所述高频多态性位点进行标记;输出标记高频多态性位点的注释序列,所述注释序列和所述原始序列的碱基长度相同;读取所述注释序列,并生成候选引物;筛选候选引物等。本发明提供的基于Primer3的bPrimer批量PCR引物设计方法能够回避高频多态性位点,减少因目标人群遗传多样性而导致的扩增失败;能够批量检测引物的特异性,减少非特异扩增、引物二聚体等原因导致的扩增失败;能够用于评估现有引物的特异性;能够对长目标片段进行自动分割。