一种基于Primer3的bPrimer批量PCR引物设计方法
基本信息
申请号 | CN201610089004.0 | 申请日 | - |
公开(公告)号 | CN105718759B | 公开(公告)日 | 2018-09-25 |
申请公布号 | CN105718759B | 申请公布日 | 2018-09-25 |
分类号 | G06F19/20 | 分类 | 计算;推算;计数; |
发明人 | 戴立忠;彭厘旻;郭鑫武;陈明;王煜;罗喜鹏 | 申请(专利权)人 | 湖南圣维基因科技有限公司 |
代理机构 | 北京弘权知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人 | 逯长明;许伟群 |
地址 | 410600 湖南省长沙市岳麓区高新技术产业开发区麓松路680号 | ||
法律状态 | - |
摘要
摘要 | 本发明提供了一种基于Primer3的bPrimer批量PCR引物设计方法,所述方法包括:获取目标DNA序列的原始序列;提取DNA多态性数据中的高频多态性位点;对所述高频多态性位点进行标记;输出标记高频多态性位点的注释序列,所述注释序列和所述原始序列的碱基长度相同;读取所述注释序列,并生成候选引物;筛选候选引物等。本发明提供的基于Primer3的bPrimer批量PCR引物设计方法能够回避高频多态性位点,减少因目标人群遗传多样性而导致的扩增失败;能够批量检测引物的特异性,减少非特异扩增、引物二聚体等原因导致的扩增失败;能够用于评估现有引物的特异性;能够对长目标片段进行自动分割。 |
